Kalcit je široko rasprostranjen u prirodi.
U plitkim morima ili jezerima, često se taloži i formira velike slojeve krečnjaka.
Podzemne vode mogu rastvoriti krečnjak i takođe reformisati kalcit, kao što su stalaktiti, stalagmiti i travertin. Podzemne vode aktivne u tlu blizu podzemnih voda često formiraju kalcitne nodule raspoređene duž određene horizontalne ravni; geolozi ih obično nazivaju vapnenačkim nodulama.
Hidrotermalna aktivnost često stvara kalcitne vene, neke sadrže minerale, a neke ne. Dobro{1}}dobro oblikovani kristali se često nalaze u geodama.
U karbonatima nastalim magmatskom aktivnošću, kalcit tipično čini oko 80%.
Nadalje, kalcit djeluje i kao cement u klastičnim sedimentnim stijenama i kao mineral dobiven izmjenom osnovnih magmatskih stijena, doprinoseći različitim stijenama. Zbog aktivnosti podzemnih voda, kalcitne žile često ispunjavaju pukotine različitih stijena.
Krečnjak formiran sedimentacijom često prolazi kroz regionalni ili kontaktni metamorfizam, tokom kojeg se kalcit unutar njega rekristalizira i formira grublje agregate kalcita{0}}mramora.
